一是健全收益分配制度。健全完善农民合作社财务制度和收益分配制度，按照《农民合作社财务会计制度》实行年终决算。召开农民合作社财务规范化管理培训班，要求系统内农民合作社编制财务报表，定期上报和公布，并按交易量和出资额进行统筹分配和“二次返利”。

二是健全农产品生产记录制度。指导农民合作社严格遵守《农产品质量安全法》等法律法规，实施农产品生产记录制度，大力推进农产品包装销售，从而实现农产品产地管理与市场准入的有效对接，保障消费安全，加快标准化、品牌化生产进程。

三是加强对系统内农民合作社的监管。根据农民合作社的具体情况，加大技术培训、人才支持和跟踪服务力度。协助合作社建立健全理事会、监事会等机构和管理制度。建立检查考核制度，对运营良好的专业合作社，采取奖励机制，在申请信贷、扶持资金、申报项目等方面给予扶持和政策倾斜。